{
  "meta": {
    "api_type": "NWO Projects API",
    "version": "1.0.2",
    "licence": {
      "name": "CC0 1.0 Universal",
      "url": "https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0",
      "description": "To the extent possible under law, all copyright and related or neighbouring rights have been waived worldwide to the data made available through this API."
    },
    "documentation": "https://doi.org/10.5281/zenodo.14918287",
    "release_date": "2025-08-20T00:00:00",
    "funder": "https://doi.org/10.13039/501100003246",
    "ror_id": "https://ror.org/04jsz6e67",
    "date": "2026-11-05T00:00:00",
    "count": 1,
    "per_page": 100,
    "pages": 1,
    "page": 1
  },
  "projects": [
    {
      "project_id": "MP-07-145-V",
      "title": "Quantumtheoretische Chemie",
      "funding_scheme_id": 2266,
      "funding_scheme": "Rekentijd nationale computersystemen Rekentijd nationale computersystemen 2007 EW",
      "department": "Exacte en Natuurwetenschappen",
      "sub_department": "Exacte Wetenschappen",
      "start_date": "2007-09-17T00:00:00",
      "end_date": "2010-07-26T00:00:00",
      "reporting_year": 2007,
      "summary_nl": "Het onderzoeksproject quantumtheoretische chemie valt uiteen in zeven deelprojecten, die in verschillende mate van de supercomputer gebruik maken. In deelprojecten A, C en D (zie\n\nhieronder) is het vooral de ontwikkeling van nieuwe methodes waarvan de performance op supercomputers getest dient te worden, terwijl daarnaast de toepassing van de ontwikkelde\n\nmethodes op grote systemen in alle deelprojecten zeer rekenintensief is.\n\nDoordat de in projekt B ontwikkelde responsemodule voor de berekening van molekulaire eigenschappen zeer goed toepasbaar is op grote molekulen worden daarmee vooral esponseigenschappen van grote moleculen, die interessant zijn voor niet-lineaire optica, berekend. Ondanks de bereikte efficiënte kosten dergelijke berekening uiteraard nog veel tijd.\n\nIn project C is de middeling van moleculaire eigenschappen (NMR, excitatiespectra) over een met MD gegenereerd ensemble van toestanden van gesolvateerde grote molekulen\n\nrekenintensief door het grote aantal toestanden waarover gemiddeld wordt. Daarnaast zal een begin worden gemaakt met het testen van ab initio moleculaire dynamica aanpak die is\n\ngebaseerd op frozen-density-embedding. In beide gevallen zijn de algorithmes goed paralleliseerbaar doordat het onafhankelijke berekening van verschillende (sub)systemen betreft.\n\nOnder project D zal ook in het komende jaar verder gewerkt worden aan de studie van verschillende actinide complexen. In dit deelproject worden volgend jaar onder meer supermolecuul berekeningen uitgevoerd om benchmarks te verschaffen voor de subsysteeem DFT aanpak die in project C wordt ontwikkeld. Hierbij wordenrelativististische coupled cluster berekeningen uitgevoerd aan systemen met tot 10 atomen, een ontwikkeling die\n\nrecent mogelijk is geworden door de implementatie van de infinite-order two-component aanpak en de optimalisatie van de parallele index transformatie stap (in het kader van een\n\nDEISA project). De berekeningen blijven echter naar verwachting rekenintensief en vragen met name veel geheugen (orde van 10 Gb/proces).\n\nIn project E worden berekeningen uitgevoerd voor reacties van molekulen op kristaloppervlakken. De aandacht wordt thans meer gericht naar interpretatie en opheldering \n\n\n\nvan de elektronenstructuur. Met de implementatie van een geheel nieuwe energiedecompositie methode voor metaal-molecuul interacties (zie verslag 2006) is het mogelijk zeer diverse effecten te bestuderen. De aandacht gaat allereerst uit naar prototypische problemen en systemen, zoals de verschillen in adsorptieenergie van een typisch adsorbaat als CO op verschillende metalen. Ook de verschillen in hoogte van dissociatiebarrière op verschillend metalen van twee-atomige moleculen zoals H2, N2, O2 zal onderwerp van onderzoek zijn.Deze projecten zijn over het algemeen minder rekenintensief dan de constructie van volledige potentiaaloppervlakken. Niettemin kunnen met name de bepalingen van overgangsbarrières nog veel tijd vergen, omdat toch delen van een PES berekend moeten worden.\n\nDe deelprojecten F en G zijn extreem rekenintensief en in hoge mate afhankelijk van de beschikbaarheid van state-of-the-art supercomputers. In deelproject F worden o.a. nieuwe\n\nmethoden voor katalysatordesign ontwikkeld. Met name het onderzoek naar sterische effecten (d.w.z. grote liganden op het metaalcentrum en/of grote substituenten in de omgeving van de te activeren binding in het substraat) alsmede de beschrijving van\n\noplosmiddeleffecten (oplosmiddelmoleculen van de eerste solvatatieschil moeten vaak als onderdeel van het QM systeem worden behandeld: \"supermolecuul\"-aanpak) zijn CPUintensief.\n\nDit geldt in nog beduidend sterkere mate voor deelproject G. Hierin worden o.a. modelreactiesysthemen voor het emplate-primer-polymerase complex onderzocht, dat een\n\nsleutelrol speelt in de DNA-replicatie.\n\nBehalve voor de hier genoemde projecten, die in het bijzonder tijdverslindend zijn, worden supercomputers op meer incidentele basis gebruikt voor andere projecten.\n\nDeze aanvraag vormt één geheel met de rapportage over de afgelopen periode, waar meer informatie over de diverse projekten gegeven wordt.\n\nDeelprojecten:\n\nA. Ontwikkeling en implementatie van dichtheidsfunctionaalmethoden\n\nHierbij worden onderscheiden: 1) Fundamentele aspecten van deze methoden, en 2) Implementatie en verbetering van het Amsterdam Density Functional (ADF) programmasysteem.\n\nB. Responsfuncties\n\nOntwikkeling van methoden ter berekening van lineaire en niet-lineaire moleculaire responsfuncties. Methoden gebaseerd op zowel ab initio-quantumchemische technieken als op tijdsafhankelijke dichtheidsfunktionaaltheorie worden ontwikkeld\n\nen toegepast op spectroscopische verschijnselen.\n\nC. Imbeddingsmethoden\n\nOntwikkeling van methoden ter berekening van moleculaire eigenschappen van systemen in oplossing. Hierbij wordt voornamelijk gewerkt aan de ontwikkeling van de bevroren\n\ndichtheids methode waarbij zowel het opgeloste molekuul alsmede een (groot) aantal oplosmiddelmolekulen met dichtheidsfunctionaal methoden wordt beschreven.D. Relativistische quantumchemie\n\nDit onderzoek beoogt de ontwikkeling van quantumchemische methodes voor de nauwkeurige berekening van eigenschappen van systemen die zware elementen bevatten.\n\nHierbij dienen relativistische effecten op de elektronenbeweging in rekening te worden gebracht. De ontwikkeling en verbetering van methodes voor relativistische berekeningen zijn belangrijke onderzoeksdoelen. De ontwikkelde methoden vinden in belangrijke mate hun toepassingen op het terrein van de actinide chemie.\n\nE. Theoretische studie van chemisorptie\n\nQuantumchemische methodes worden ontwikkeld en gebruikt voor berekeningen aan modelsystemen voor chemisorptie, om inzicht te krijgen in de adsorptieve eigenschappen van vaste stoffen. Ook worden reacties aan oppervlakken, i.h.b. dissociatie van kleine moleculen op metalen, bestudeerd.\n\nF. Structuur, Reactiviteit en Katalyse\n\nDit deelproject valt uiteen in drie aandachtsgebieden: (E1) de ontwikkeling van concepten waarmee chemische binding en structuur enerzijds en reactiviteit anderzijds\n\nbeschreven en begrepen kunnen worden; (E2) rationele, fragment-georiënteerde katalysatordesign (vooral voor oxidatieve additie), waarbij gebruik gemaakt wordt van in\n\nE1 ontwikkelde concepten; E3) de studie van (oplosmiddeleffecten op) metaalgekatalyseerde reacties met behulp van ab initio moleculaire dynamica (Car-\n\nParrinello).\n\nG. Theoretische Biochemie en Moleculaire Herkenning\n\nIn dit deelproject worden molecuulherkenningsprocessen bestudeerd, toegespitst op de\n\nWatson-Crick-basenparing in DNA. Hierbij wordt getracht de oorzaak van selectiviteit bij de moleculaire herkenning op basis van de electronische structuur te begrijpen. Eén tak van dit onderzoek richt zich specifiek op DNA en de moleculaire basis van de genetische code alsmede het effect van chemisch of fysisch (straling) geïnduceerde beschadigingen. Een tweede doelstelling is het ontwerp van monomere eenheden, die tot\n\ncontroleerbare moleculaire herkenning in staat zijn. Op de langere termijn moet dit leiden tot een theoriegeleide ontwikkeling van zelforganiserende systemen, wier activiteit \n\nchemisch (activerende of deactiverende agentia) of fysisch (straling) gecontroleerd kan worden. Een nieuw zwaartepunt is de opheldering van het reactiemechanisme van de \n\nDNA-replicatie (transscriptie).",
      "summary_en": "Het onderzoeksproject quantumtheoretische chemie valt uiteen in zeven deelprojecten, die in verschillende mate van de supercomputer gebruik maken. In deelprojecten A, C en D (zie\n\nhieronder) is het vooral de ontwikkeling van nieuwe methodes waarvan de performance op supercomputers getest dient te worden, terwijl daarnaast de toepassing van de ontwikkelde\n\nmethodes op grote systemen in alle deelprojecten zeer rekenintensief is.\n\nDoordat de in projekt B ontwikkelde responsemodule voor de berekening van molekulaire eigenschappen zeer goed toepasbaar is op grote molekulen worden daarmee vooral esponseigenschappen van grote moleculen, die interessant zijn voor niet-lineaire optica, berekend. Ondanks de bereikte efficiënte kosten dergelijke berekening uiteraard nog veel tijd.\n\nIn project C is de middeling van moleculaire eigenschappen (NMR, excitatiespectra) over een met MD gegenereerd ensemble van toestanden van gesolvateerde grote molekulen\n\nrekenintensief door het grote aantal toestanden waarover gemiddeld wordt. Daarnaast zal een begin worden gemaakt met het testen van ab initio moleculaire dynamica aanpak die is\n\ngebaseerd op frozen-density-embedding. In beide gevallen zijn de algorithmes goed paralleliseerbaar doordat het onafhankelijke berekening van verschillende (sub)systemen betreft.\n\nOnder project D zal ook in het komende jaar verder gewerkt worden aan de studie van verschillende actinide complexen. In dit deelproject worden volgend jaar onder meer supermolecuul berekeningen uitgevoerd om benchmarks te verschaffen voor de subsysteeem DFT aanpak die in project C wordt ontwikkeld. Hierbij wordenrelativististische coupled cluster berekeningen uitgevoerd aan systemen met tot 10 atomen, een ontwikkeling die\n\nrecent mogelijk is geworden door de implementatie van de infinite-order two-component aanpak en de optimalisatie van de parallele index transformatie stap (in het kader van een\n\nDEISA project). De berekeningen blijven echter naar verwachting rekenintensief en vragen met name veel geheugen (orde van 10 Gb/proces).\n\nIn project E worden berekeningen uitgevoerd voor reacties van molekulen op kristaloppervlakken. De aandacht wordt thans meer gericht naar interpretatie en opheldering \n\n\n\nvan de elektronenstructuur. Met de implementatie van een geheel nieuwe energiedecompositie methode voor metaal-molecuul interacties (zie verslag 2006) is het mogelijk zeer diverse effecten te bestuderen. De aandacht gaat allereerst uit naar prototypische problemen en systemen, zoals de verschillen in adsorptieenergie van een typisch adsorbaat als CO op verschillende metalen. Ook de verschillen in hoogte van dissociatiebarrière op verschillend metalen van twee-atomige moleculen zoals H2, N2, O2 zal onderwerp van onderzoek zijn.Deze projecten zijn over het algemeen minder rekenintensief dan de constructie van volledige potentiaaloppervlakken. Niettemin kunnen met name de bepalingen van overgangsbarrières nog veel tijd vergen, omdat toch delen van een PES berekend moeten worden.\n\nDe deelprojecten F en G zijn extreem rekenintensief en in hoge mate afhankelijk van de beschikbaarheid van state-of-the-art supercomputers. In deelproject F worden o.a. nieuwe\n\nmethoden voor katalysatordesign ontwikkeld. Met name het onderzoek naar sterische effecten (d.w.z. grote liganden op het metaalcentrum en/of grote substituenten in de omgeving van de te activeren binding in het substraat) alsmede de beschrijving van\n\noplosmiddeleffecten (oplosmiddelmoleculen van de eerste solvatatieschil moeten vaak als onderdeel van het QM systeem worden behandeld: \"supermolecuul\"-aanpak) zijn CPUintensief.\n\nDit geldt in nog beduidend sterkere mate voor deelproject G. Hierin worden o.a. modelreactiesysthemen voor het emplate-primer-polymerase complex onderzocht, dat een\n\nsleutelrol speelt in de DNA-replicatie.\n\nBehalve voor de hier genoemde projecten, die in het bijzonder tijdverslindend zijn, worden supercomputers op meer incidentele basis gebruikt voor andere projecten.\n\nDeze aanvraag vormt één geheel met de rapportage over de afgelopen periode, waar meer informatie over de diverse projekten gegeven wordt.\n\nDeelprojecten:\n\nA. Ontwikkeling en implementatie van dichtheidsfunctionaalmethoden\n\nHierbij worden onderscheiden: 1) Fundamentele aspecten van deze methoden, en 2) Implementatie en verbetering van het Amsterdam Density Functional (ADF) programmasysteem.\n\nB. Responsfuncties\n\nOntwikkeling van methoden ter berekening van lineaire en niet-lineaire moleculaire responsfuncties. Methoden gebaseerd op zowel ab initio-quantumchemische technieken als op tijdsafhankelijke dichtheidsfunktionaaltheorie worden ontwikkeld\n\nen toegepast op spectroscopische verschijnselen.\n\nC. Imbeddingsmethoden\n\nOntwikkeling van methoden ter berekening van moleculaire eigenschappen van systemen in oplossing. Hierbij wordt voornamelijk gewerkt aan de ontwikkeling van de bevroren\n\ndichtheids methode waarbij zowel het opgeloste molekuul alsmede een (groot) aantal oplosmiddelmolekulen met dichtheidsfunctionaal methoden wordt beschreven.D. Relativistische quantumchemie\n\nDit onderzoek beoogt de ontwikkeling van quantumchemische methodes voor de nauwkeurige berekening van eigenschappen van systemen die zware elementen bevatten.\n\nHierbij dienen relativistische effecten op de elektronenbeweging in rekening te worden gebracht. De ontwikkeling en verbetering van methodes voor relativistische berekeningen zijn belangrijke onderzoeksdoelen. De ontwikkelde methoden vinden in belangrijke mate hun toepassingen op het terrein van de actinide chemie.\n\nE. Theoretische studie van chemisorptie\n\nQuantumchemische methodes worden ontwikkeld en gebruikt voor berekeningen aan modelsystemen voor chemisorptie, om inzicht te krijgen in de adsorptieve eigenschappen van vaste stoffen. Ook worden reacties aan oppervlakken, i.h.b. dissociatie van kleine moleculen op metalen, bestudeerd.\n\nF. Structuur, Reactiviteit en Katalyse\n\nDit deelproject valt uiteen in drie aandachtsgebieden: (E1) de ontwikkeling van concepten waarmee chemische binding en structuur enerzijds en reactiviteit anderzijds\n\nbeschreven en begrepen kunnen worden; (E2) rationele, fragment-georiënteerde katalysatordesign (vooral voor oxidatieve additie), waarbij gebruik gemaakt wordt van in\n\nE1 ontwikkelde concepten; E3) de studie van (oplosmiddeleffecten op) metaalgekatalyseerde reacties met behulp van ab initio moleculaire dynamica (Car-\n\nParrinello).\n\nG. Theoretische Biochemie en Moleculaire Herkenning\n\nIn dit deelproject worden molecuulherkenningsprocessen bestudeerd, toegespitst op de\n\nWatson-Crick-basenparing in DNA. Hierbij wordt getracht de oorzaak van selectiviteit bij de moleculaire herkenning op basis van de electronische structuur te begrijpen. Eén tak van dit onderzoek richt zich specifiek op DNA en de moleculaire basis van de genetische code alsmede het effect van chemisch of fysisch (straling) geïnduceerde beschadigingen. Een tweede doelstelling is het ontwerp van monomere eenheden, die tot\n\ncontroleerbare moleculaire herkenning in staat zijn. Op de langere termijn moet dit leiden tot een theoriegeleide ontwikkeling van zelforganiserende systemen, wier activiteit \n\nchemisch (activerende of deactiverende agentia) of fysisch (straling) gecontroleerd kan worden. Een nieuw zwaartepunt is de opheldering van het reactiemechanisme van de \n\nDNA-replicatie (transscriptie).",
      "project_members": [
        {
          "role": "Project leader",
          "member_id": 104169,
          "last_name": "Baerends",
          "degree_pre_nominal": "prof. dr.",
          "initials": "E.J.",
          "first_name": "Evert Jan",
          "organisation": "Vrije Universiteit Amsterdam||Faculteit der Bètawetenschappen (Faculty of Science)||Afdeling Scheikunde & Farmaceutische Wetenschappen||Theoretische Chemie",
          "organisation_id": 61203,
          "ror": "https://ror.org/008xxew50",
          "active": false
        },
        {
          "role": "Main Applicant",
          "member_id": 104169,
          "last_name": "Baerends",
          "degree_pre_nominal": "prof. dr.",
          "initials": "E.J.",
          "first_name": "Evert Jan",
          "organisation": "Vrije Universiteit Amsterdam||Faculteit der Bètawetenschappen (Faculty of Science)||Afdeling Scheikunde & Farmaceutische Wetenschappen||Theoretische Chemie",
          "organisation_id": 61203,
          "ror": "https://ror.org/008xxew50",
          "active": true
        }
      ]
    }
  ]
}
